Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS1P54277 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS1P54277 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS1P54277 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS1P54277 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS1P54277 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS1P54277 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS1P54277 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS1P54277 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS1P54277 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS1P54277 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS1P54277 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS1P54277 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS1P54277 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS1P54277 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS1P54277 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS1P54277 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS1P54277 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS1P54277 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS1P54277 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS1P54277 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS1P54277 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS1P54277 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS1P54277 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS1P54277 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS1P54277 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS1P54277 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS1P54277 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS1P54277 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS1P54277 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS1P54277 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS1P54277 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS1P54277 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms