Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP13P45452 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP13P45452 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP13P45452 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP13P45452 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP13P45452 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP13P45452 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP13P45452 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP13P45452 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP13P45452 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP13P45452 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP13P45452 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP13P45452 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP13P45452 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP13P45452 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP13P45452 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP13P45452 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms