Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ITGAEP38570 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITGAEP38570 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms