Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SERPINF1P36955 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SERPINF1P36955 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms