Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF2E1P29083 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF2E1P29083 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms