Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME1P15531 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME1P15531 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME1P15531 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME1P15531 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME1P15531 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME1P15531 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME1P15531 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME1P15531 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME1P15531 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME1P15531 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME1P15531 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME1P15531 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME1P15531 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME1P15531 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME1P15531 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME1P15531 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME1P15531 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME1P15531 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME1P15531 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NME1P15531 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME1P15531 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME1P15531 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME1P15531 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME1P15531 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms