Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RARBP10826 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARBP10826 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RARBP10826 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RARBP10826 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARBP10826 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARBP10826 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARBP10826 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RARBP10826 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RARBP10826 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RARBP10826 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms