Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBSP08397 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBSP08397 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBSP08397 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBSP08397 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBSP08397 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBSP08397 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBSP08397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBSP08397 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBSP08397 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBSP08397 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMBSP08397 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMBSP08397 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMBSP08397 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMBSP08397 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMBSP08397 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBSP08397 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBSP08397 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBSP08397 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBSP08397 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMBSP08397 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMBSP08397 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMBSP08397 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMBSP08397 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMBSP08397 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMBSP08397 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms