Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRNPP04156 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRNPP04156 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRNPP04156 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRNPP04156 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRNPP04156 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRNPP04156 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRNPP04156 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRNPP04156 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRNPP04156 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms