Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCNT3O95395 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCNT3O95395 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms