Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD4O95243 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD4O95243 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD4O95243 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD4O95243 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD4O95243 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD4O95243 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MBD4O95243 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD4O95243 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD4O95243 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD4O95243 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD4O95243 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD4O95243 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD4O95243 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD4O95243 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD4O95243 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD4O95243 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD4O95243 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD4O95243 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD4O95243 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD4O95243 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD4O95243 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD4O95243 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD4O95243 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD4O95243 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD4O95243 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD4O95243 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD4O95243 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MBD4O95243 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD4O95243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD4O95243 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD4O95243 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD4O95243 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD4O95243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MBD4O95243 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MBD4O95243 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MBD4O95243 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD4O95243 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD4O95243 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD4O95243 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD4O95243 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD4O95243 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MBD4O95243 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MBD4O95243 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MBD4O95243 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MBD4O95243 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms