Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6AO75865 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAPPC6AO75865 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC6AO75865 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms