Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSO75390 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSO75390 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSO75390 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSO75390 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSO75390 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSO75390 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSO75390 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSO75390 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSO75390 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSO75390 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSO75390 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSO75390 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSO75390 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSO75390 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSO75390 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSO75390 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSO75390 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSO75390 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSO75390 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSO75390 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSO75390 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CSO75390 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms