Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX3O60493 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX3O60493 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX3O60493 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX3O60493 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX3O60493 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX3O60493 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX3O60493 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX3O60493 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms