Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GGTLC3B5MD39 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GGTLC3B5MD39 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms