Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC1A8K0Z3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WASHC1A8K0Z3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms