Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRIQ3A6PVS8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ3A6PVS8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms