Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS9D1Q9Y2B5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS9D1Q9Y2B5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms