Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSL6Q9UKU0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSL6Q9UKU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms