Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM7Q9UK45 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSM7Q9UK45 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSM7Q9UK45 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms