Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXD3Q9UJU5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXD3Q9UJU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms