Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX25Q9UHL0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX25Q9UHL0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DDX25Q9UHL0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms