Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMC4Q9NTJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMC4Q9NTJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms