Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PREBQ9HCU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PREBQ9HCU5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PREBQ9HCU5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms