Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCBP2Q9H190 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDCBP2Q9H190 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCBP2Q9H190 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms