Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC106Q9BWC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC106Q9BWC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms