Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDCD1Q96RS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDCD1Q96RS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms