Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
COG3Q96JB2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
COG3Q96JB2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
COG3Q96JB2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
COG3Q96JB2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms