Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX27Q96GQ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX27Q96GQ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms