Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SRSF12Q8WXF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF12Q8WXF0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.4 ms