Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC9Q8TBE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNDC9Q8TBE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms