Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C2CD4AQ8NCU7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2CD4AQ8NCU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms