Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFCDQ8IXH7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NELFCDQ8IXH7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFCDQ8IXH7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms