Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PASD1Q8IV76 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PASD1Q8IV76 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PASD1Q8IV76 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms