Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC01551Q86U37 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC01551Q86U37 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms