Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BHLHA9Q7RTU4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BHLHA9Q7RTU4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms