Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC62Q6P9F0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC62Q6P9F0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms