Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED27Q6P2C8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED27Q6P2C8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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