Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUD3Q5T2D3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUD3Q5T2D3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms