Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC93Q567U6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC93Q567U6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms