Protein–RNA interactions for Protein: Q53S58

TMEM177, Transmembrane protein 177, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM177Q53S58 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM177Q53S58 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM177Q53S58 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms