Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf17Q53FE4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf17Q53FE4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms