Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICAQ29983 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICAQ29983 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MICAQ29983 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MICAQ29983 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MICAQ29983 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICAQ29983 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MICAQ29983 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MICAQ29983 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MICAQ29983 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICAQ29983 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICAQ29983 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICAQ29983 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MICAQ29983 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MICAQ29983 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MICAQ29983 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MICAQ29983 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms