Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME3Q16798 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME3Q16798 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME3Q16798 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME3Q16798 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME3Q16798 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME3Q16798 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME3Q16798 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME3Q16798 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME3Q16798 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME3Q16798 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME3Q16798 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME3Q16798 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ME3Q16798 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ME3Q16798 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ME3Q16798 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ME3Q16798 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME3Q16798 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME3Q16798 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ME3Q16798 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME3Q16798 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME3Q16798 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME3Q16798 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME3Q16798 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME3Q16798 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME3Q16798 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME3Q16798 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ME3Q16798 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
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