Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC18A3Q16572 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC18A3Q16572 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
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