Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX2Q16385 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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SSX2Q16385 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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