Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMAD1Q15797 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD1Q15797 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms