Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB35Q15286 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RAB35Q15286 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RAB35Q15286 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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RAB35Q15286 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAB35Q15286 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAB35Q15286 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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