Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX3Q13761 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX3Q13761 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX3Q13761 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms