Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTCH1Q13635 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTCH1Q13635 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTCH1Q13635 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
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